Jedan od uobičajenih problema u vezi s jatima u dvorištu odnosi se na loše ili neadekvatne programe hranjenja koji mogu dovesti do nedostatka vitamina i minerala kod ptica. Vitamini i minerali vrlo su važne komponente prehrane za kokoši i ako formuliran obrok nije hrana, vjerojatno će doći do nedostatka.

Peradi su potrebni svi poznati vitamini osim C. Neki su vitamini topivi u mastima, dok su drugi topivi u vodi. Neki od simptoma nedostatka vitamina su sljedeći:
Vitamini topljivi u mastima
Vitamin A Smanjena proizvodnja jaja, slabost i nedostatak rasta
Vitamin D Jaja s tankom ljuskom, smanjena proizvodnja jaja, usporen rast, rahitis
Vitamin E Povećani skočni zglobovi, encefalomalacija (bolest ludih pilića)
Vitamin K Produljeno zgrušavanje krvi, intramuskularno krvarenje
 
Vitamini topljivi u vodi
Tiamin (B1) Gubitak apetita i smrt
Riboflavin (B2) Paraliza kovrčavih nožnih prstiju, slab rast i slaba proizvodnja jaja
Dermatitis pantotenske kiseline i lezije na ustima i stopalima
Niacin Pogrbljene noge, upala jezika i usne šupljine
Kolin Loš rast, masna jetra, smanjena proizvodnja jaja
Vitamin B12 Anemija, slab rast, embrionalna smrtnost
Folna kiselina Loš rast, anemija, slabo perje i proizvodnja jaja
Biotin Dermatitis na stopalima i oko očiju i kljuna
Minerali su također važni za zdravlje i dobrobit peradi. Slijede neki od važnih minerala i simptomi nedostatka minerala:
Minerali
Kalcij Loša kvaliteta ljuske jajeta i slaba valivost, rahitis
Fosforni rahitis, loša kvaliteta ljuske i valivost jaja
Magnezij Iznenadna smrt
Mangan Perosis, loša valivost
Anemija željeza
Bakrena anemija
Jodna gušavost
Cink Loše perje, kratke kosti
Kobalt Spor rast, smrtnost, smanjena valivost
Kao što je gore navedeno, nedostatak vitamina i minerala može uzrokovati brojne zdravstvene probleme za kokoši uključujući u nekim slučajevima i smrt. Stoga, kako bi se spriječili prehrambeni nedostaci ili kada se uoče simptomi nedostatka, treba prakticirati hranidbu peradi uravnoteženom hranom s potrebnim vitaminima i mineralima.